上一季结尾，陈末向赵小雨深情告白没有得到回应，而为此小雨错过了暖男学霸苏舟的MP3表白。另一边，表白被拒的于贝贝和直击“车祸现场”的姚从良燃起了“友谊”的小火苗。第二季，经历了高二文理分班，陈末和他的一帮好友，努力学习可成…

该片讲述胥梓彤和战友成功从一伙劫匪手中解救出被绑人质，随后被选入一个特别行动小组，执行侦破有关某跨境贩毒组织DIT的在华组织成员的秘密任务，不想对手却十分毒辣狡猾，在警方的层层追捕下，竟丧心病狂以炸弹威胁数万人的生命胥梓桐…

青春就像一场大雨，即使感冒了，还盼望回头再淋它一次！你是否幻想过一觉醒来，发现自己在高中教室里上课, 然后告诉你的同桌，我做了一个很长很长的梦。三十岁的陈末每天看似匆忙，实则碌碌无为。白天西装革履，人模狗样，晚上却待在一间…

病由心生，人心千奇百怪，故所得之病也千奇百怪。专治各种怪病的“诡医”，因为神秘的目的游走于世间。以病患最珍视之物作为医资，为各异人治疗怪病——会说出病患内心想法的人面疮、渴望母爱的孩子幻想出的母亲……一个个怪诞却触动人心…

青春网络剧教室的那一间2剧情讲述了陈末、赵小雨、苏舟、于贝贝等人的高中生活，有关于懵懂的爱情，有关于坚定的友情，有关于青涩的梦想的故事。